De Pro Evolution Soccer-games behoren al jaren bij de populairste en beste voetbalgames ter wereld. Ook in dit deel is de Master League de belangrijkste spelmodus. Hierin selecteer je een team en zorg je ervoor dat deze de top bereikt in de voetballerij. Met elke wedstrijd die je wint en elke achievement die je behaalt win je PES-punten. Met deze punten kun je klassieke teams, spelers, stadions en meer vrijspelen.

De belangrijkste vernieuwing in Pro Evolution 2008 ten opzichte van het vorige deel is waarschijnlijk de verbetering van de kunstmatige intelligentie. Het nieuwe AI-systeem heet Teamvision en zorgt ervoor dat je medespelers en tegenstanders meer als een team spelen en het je aanzienlijk moeilijker maken. Je tegenstanders zullen tactieken ontwikkelen om aanvallen op te bouwen, ze passen sneller en zijn agressiever.